Rzeka bierze początek w jeziorze Kruklin (okolice wsi Spytkowo), płynie poprzez jeziora Gołdopiwo, Wilkus (i jego odnogę Brzoś), Pozezdrze, Stręgiel, uchodzi do jeziora Święcajty (które jest częścią kompleksu jeziora Mamry) w Ogonkach gminie Węgorzewo. Ujście Sapiny wspaniale widać ze ścieżki rowerowej z ogoneckiego mostu tuż nad Święcajtami (na drodze krajowej 63).

Sapinę można przemierzyć spływem kilkudniowym (z Kruklina aż do Święcajt) lub pokonywać etapami, spływami jednodniowymi, kilkugodzinnymi (np. na trasach Kruklin-Gołdopiwo, ok. trzech godzin lub Gołdopiwo-Święcajty, ok. sześciu godzin). Wzdłuż rzeki na turystów czekają liczne pola kempingowe, domki letniskowe, gospodarstwa agroturystyczne.